始建于明朝万历四十年（公元1612年），举人李惟凤、刘如性及生员陈奎聚等筹资兴建。
塔呈八面形，取“天、地、阴、阳、风、雷、水、火”八卦之意。
每层外檐角均设风摆铜铃，共七十二个，是典型的中国古建筑。
原名“文昌塔”，又称“狮子塔”。
塔高50米，外观9层，内11层。
粉墙红柱，八面设门窗或龛。
造型古雅，工艺精湛，为广东省级文物保护单位。
塔顶供奉万世师表的孔子像。
《广东新语》载：群千数人于其中，日夜锤凿不息。
下至三泉，中訇千穴，地脉为之中绝，山气为之不流。
一峰之肌肤已剥，一洞之骨髓复穷，土衰火死，水泉渐焦，无以兴云吐雨、滋润万物而发育人民。
《番禺县志》（清.同治）载，广州府于明朝时期即多次出示封禁，但私自开山采石仍屡禁不止。
乡绅崔奇观等多次呈称“石砺山下捍虎门，上卫羊城，合省风水，倚为重镇，倾之使陷，致伤风水，乞批严禁”。
其时，南粤瘟疫横行，民不聊生，遂于“主峰建塔，增高添厚，固地脉事，消除瘟疫”。
因此，莲花塔是风水塔。
1938年，莲花塔受日军炮火轰击，二、三、四、七层东南面的塔身轰烂，却始终未能击倒。
1981年，番禺籍澳门知名人士何添、何贤兄弟捐资修塔，莲花塔重新焕发英姿。
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