红曲的工艺，主要掌握五个环节：
一、生产红曲：必须选用优质大米。
一般大米必须经过再一次的碾白工序排除米糠、碎米及、谷皮、杂质，直到纯度100%，选好料后，把它放进水池流水浸泡24—36小时，水比大米高出30厘米，使它吸收水分。
然后取出，置于蒸床内蒸熟，时间掌握5—10分钟，气压4.5公斤的1吨锅炉，温度150℃，蒸后倒出成堆。
然后再进行第二次复蒸（时间约为5—10分钟），使大米蒸至透心时取出，铺摊于竹箩上，冷却至20℃上下备用。
二、配方拌料：经过蒸熟冷却后的大米，拌同醋糟辅料配制红曲霉培养基。
其配方有二种：
（1）大米100斤，老醋3斤（要求3年以上的陈醋）土曲糟5斤。
（2）大米100斤，红曲7斤，米饭5斤，老醋5斤。
配方一把老醋、土曲糟拌进蒸熟的大米搅拌均匀，达到米饭通红为止。
配方二则先把红曲磨成粉末，米饭煮至如稀饭一样稠粘后，把初曲及醋拌进，然后调到蒸熟的大米中去，反复搅拌直至通红。
如用搅拌机，每小时可拌4千斤。
三、室内发酵：
红曲主要依靠红曲霉菌的繁殖与生长，它所适宜的温度为40—45℃。
发酵室必须洁净无味，室内宜用粘土与砂质土壤合成的地面。
这种地面容易干燥，每隔一年半后还要进行一次更新，以利交赤散于室内地坪。
打开通风窗15分钟后第二次发酵时，再把它集中成山形，加麻袋覆盖，密封6小时，堆温以35℃为宜。
然后又铺散于地面，室温不宜低于20℃，保持闵12小时后，开窗通风，并翻动一次，使其均匀。
再经12小时后又进行一次翻动，继之每隔8小时翻动一次，目的是使底、面均匀。
若室温不足可用电热或炭火加温。
夏天气温高时注意通风或以其他设备降温。
各个曲种的发酵期有所不同。
若是制库曲，在室内应发酵9天，每10斤大米可制成4.5—5斤重量的红曲；若是制色曲，室内要多发酵5天，使红曲霉蔓延至内部，以内外呈通红无斑点为度，每10斤大米，只能制出2.5—3斤曲量；若是制轻曲，只要多发酵2天，室温保持40℃使全部米心发酵通红，每10斤大米制3—4斤曲量。
四、加温发酵：
为使红霉菌加快繁殖，红曲在发酵过程需要加温，促进发酵。
因此，在发酵4天后，用麻袋将曲种装好，放入水池，使其吸足水分后提起（约20分钟），再回到发酵室内堆成山形，密封2天，室内温度不得低于30℃。
然后摊开铺散于地面，打开通风窗，并喷洒清水。
每100斤大米，喷清水40—50斤，用喷壶喷洒均匀。
以后每隔一天翻动一次，使上下温差平衡，发酵均匀，直到出房为止。
五、出房曝晒：
红曲从大米至发酵结束，全流程只需9—14天时间，发酵好的红曲及时提出铺于竹席上，置于列日下曝晒。
晒曲时间，春、秋、冬各12小时，夏天7小时，晒曲时要翻动5次，使其干度均匀。
若红曲出房期正逢阴雨天，必须把红曲摊铺于通风地板上晾干。
红曲成品表面红中含青，用手指捻，可成红粉末，色泽艳丽。
成品用袋包装后，应置于密封仓内保管，防止受潮。
若贮藏时间过长，发现生虫，必须及时翻晒，用烈日强光驱杀，切不可用药物毒杀。
