马蹄莲品种较多，主要有白梗马蹄莲、红梗马蹄莲、青梗马蹄莲这三个品种。
1、白梗马蹄莲： 块茎较小，生长较慢。
但开花早，着花多，花梗白色，佛焰苞大而圆。
2、红梗马蹄莲：花梗基部稍带红晕，开花稍晚于白梗马蹄莲，佛焰苞较圆。
3、青梗马蹄莲：块茎粗大，生长旺盛，开花迟。
花梗粗壮，略呈三角形。
佛焰苞端尖且向后翻卷，黄白色，体积较上两种小。
除此之外，同属还有常见的栽培种，如：
4、黄花马蹄莲：苞片略小，金黄色，叶鲜绿色，具白色透明斑点。
深黄，花期7月～8月份，冬季休眠。
5、红花马蹄莲：苞片玫红色，叶披针形，矮生，花期6月份。
6、银星马蹄莲：叶具白色斑块，佛焰苞白色或淡黄色，基部具紫红色斑，花期7月～8月份，冬季休眠。
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